Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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