Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms