Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms