Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp988F6VKC7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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