Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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