Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms