Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms