Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
6430550D23RikE9Q1X6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
6430550D23RikE9Q1X6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms