Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms