Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms