Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc17E9PVB5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms