Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3252E9PUT9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3252E9PUT9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms