Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf217D3YYI7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms