Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm17333C6EQI3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm17333C6EQI3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm17333C6EQI3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm17333C6EQI3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm17333C6EQI3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm17333C6EQI3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm17333C6EQI3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm17333C6EQI3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm17333C6EQI3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm17333C6EQI3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm17333C6EQI3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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