Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nxpe3B9EKK6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nxpe3B9EKK6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nxpe3B9EKK6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nxpe3B9EKK6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nxpe3B9EKK6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nxpe3B9EKK6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nxpe3B9EKK6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nxpe3B9EKK6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nxpe3B9EKK6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nxpe3B9EKK6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms