Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms