Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms