Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms