Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trgv2A2J008 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms