Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ambra1A2AH22 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms