Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms