Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm5538W4VSP6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm5538W4VSP6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm5538W4VSP6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm5538W4VSP6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm5538W4VSP6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm5538W4VSP6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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