Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria3Q9Z2W9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms