Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf3Q9Z2L7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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