Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt16Q9Z2K1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms