Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms