Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms