Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms