Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ror1Q9Z139 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms