Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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