Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms