Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim10Q9WUH5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim10Q9WUH5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim10Q9WUH5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim10Q9WUH5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim10Q9WUH5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim10Q9WUH5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim10Q9WUH5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim10Q9WUH5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trim10Q9WUH5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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