Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms