Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcm1Q9R0L6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms