Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp21Q9QZL6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp21Q9QZL6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms