Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms