Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms