Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms