Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plxnb3Q9QY40 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms