Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms