Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms