Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms