Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scamp4Q9JKV5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms