Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms