Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms