Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms