Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Uchl3Q9JKB1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Uchl3Q9JKB1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Uchl3Q9JKB1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Uchl3Q9JKB1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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