Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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