Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms