Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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